レストランなどでよく耳にする「goes with」と「comes with」の違いは何ですか？

「Goes with」は「〇〇に合う」という意味になります。一方、「comes with」は「〇〇が（一緒に）付いて来る」という意味になります。

The spicy dressing goes with the salad.

ピリッとするドレッシングがこのサラダに合う。

The bread comes with this soup.

このスープにはパンが付いて来る。

「eat out」と「eat outside」の違いは何ですか？

「eat out」は、「外食する」という意味です。
一方、「eat outside」は、「屋外で食べる」という意味です。

I don’t like to cook, so I always eat out.

私は料理をするのが嫌いである為、いつも外食する。

The weather was nice, so we decided to eat outside today.

天気が良かったので、私たちは今日、屋外で食べることにした。