いいえ、入れ替えて使用することはできません。
「A and B」の場合、「and」は「と」という意味を持ち、「A」と「B」は同じ重要性を持ちます。 尚、「A and B」が主語である場合、動詞は複数形になります。
Adam and Bob are out sick with the flu.
AdamとBobは、インフルエンザにかかって休んでいる。
一方、「A as well as B」の場合、「BだけでなくAも」という意味を持ち、「as well as」の前に来る「A」が、「B」よりも強調されます。また、「A as well as B」が主語である場合、動詞は単数形になります。
Adam as well as Bob is out sick with the flu.
BobだけでなくAdamも、インフルエンザにかかって休んでいる。
難易度：7/10
関連リンク：「私と彼女」といいたい場合、「her and I」で合っていますか？
一般的に、「but」が別の文として単独で成り立つ二つの節を繋ぐ場合、「but」の前に「,（コンマ）」が必要です。
I wanted to go to the concert, but the tickets were sold out.
「I wanted to go to the concert」と「The tickets were sold out」は両方とも完全な文である為、「but」の前に「,（コンマ）」が必要です。
尚、上記の例文のように、各節の主語が明確に表記されている場合、「but」の前に「,（コンマ）」が必要です。但し、例外として主語が明確な二つの節が両方とも短い場合、「,（コンマ）」を除外することができます。
I went home but no one was home.
一方、二つの節の主語が同じで、二つ目の節の主語が省略される場合は、「,（コンマ）」は必要ありません。
I wanted to go to the concert but decided to stay home.
尚、以下の等位接続詞にも同様のルールが適用されます。
-and
-so
-or
-for
-yet
-nor
難易度：8/10
関連リンク：文章の中で名詞を並べて表示する場合、「and」はどこに入れる？
文章の中で名詞を並べて表示する場合、「and」は最後の名詞の前に入れます。
従って、複数の名詞を並べて表示する場合は以下のようになります。
2つの場合：
The flag is red and white.
3つの場合：
The flag is red, white and blue.
4つの場合：
The flag is red, white, blue and yellow.
話すときもなるべく意識しましょう。
※上記のように3つ以上のものをリストする場合、「and」の前に「,（Oxford コンマ）」を入れることもできますが、AP Style（アメリカで採用されている記事を書く際の基準）では使用しません。
参考：AP Style
難易度：2/10
関連リンク：「Because」と「since」の違いは？