「Instead of」は「〜の代わりに」の意味で「代替」を表し、「rather than」は「〜よりも」の意味で「好み」を表します。
Instead of walking, I’ll drive.
私は歩く代わりに運転する。（歩くのはNG）
I prefer driving rather than walking.
私は歩くよりも運転したい。（歩いてもいいけど、どちらかと言ったら運転する方が好ましい。）
ビジネスの日程調整など、「どちらでもいいのか（rather than）」、それとも「片方しかダメ（instead of）」なのかを使い分け、しっかり意思表示しましょう。
どっちがどっちか迷ってしまう場合は、下記のセリフを覚えておくと役に立つかもしれません。
I’d rather kill myself (than do that).
（それをするなら）死んだ方がマシだ。
難易度：5/10
関連リンク：「If」と「 when」の違いは何ですか？